朱由检兑现了承诺，他为徐光启提供了一切便利的条件，工部在京师的东北角，给徐光启找到一所极位庞大的闲置府邸，让徐光启组建大明科学院。

        几乎与此同时，新编第七军、第八军整编结束。

        四月，新编第一军、第二军、第三军、皇家第一军、皇家第二军整编结束，全面进行实战演习。

        五月，新编第四军、第五军、第六军整编结束。

        至此，京师军全部整编结束，三十余万军队，整编成十个军，其中皇家第一军、皇家第二军是朱由检的亲军，只受朱由检节制。

        六月底，大明科学院正式开始招生，徐光启担任大明科学院的第一任院长。

        根据朱由检的意见，科学院设数学班、地理班、化学班、物理班、生物班、医药卫生班等。

        学制为一年制和两年制。

        在朱由检的设想中，一年制速成班，主要是培养科学方面的教师，将来北五省都会设立科技学院，速成班的毕业生将主要成为这些科技学院的教员。

        两年制深化班才是培养真正科技人才的，这些毕业生不会出去做官，而是留在科学院进行研究工作，或者进入工厂、火器局研发院，或者进入朱由检的私人企业。

        为了扩大科学院的影响，改变士林对科学的认识，吸引更多的教员学员，朱由检决定，在适当的时候，将亲自为科学院授课。

        七月二日，新编第一军、第二军、第三军即将离开京师，开赴山海关，接替山海关总兵马世龙。新军到达山海关后，马世龙的十万辽东军将撤回京师，进行整编。

        朱由检明确表示，第二军、第三军都接受第一军军长袁崇焕的节制，到达山海关之后，三个军还将接受孙承宗的总督。

        朱由检亲自到东直门为袁崇焕送行。

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